[Chimera-users] Chimera software error

Conrad Huang conrad at cgl.ucsf.edu
Tue Jan 2 12:34:29 PST 2018


Hi, Mohammed.

It looks like you are trying to use a locally installed copy of vina. 
Is that correct?  If so, please try putting quotes around the entire 
path to the vina executable and let me know whether that helps.  Thanks.

Conrad

On 12/30/2017 9:49 AM, محمد عوض على خالد wrote:
> Hello everyone.
> I am interested in using the builtin vina docking tool in Chimera.
> I get stuck several times at the following Error:
> ( Running AutoDock Vina for 5x5d failed; see Reply Log for more information:
> Application stderr
> -----
> 'C:\Program' is not recognized as an internal or external command, 
> operable program or batch file.
> -----
> Application stdout)
> I check for several tutorials but got the same error,
> the version I used is Chimera 1.12 and Ulpha version 1.13 in windows 10 
> platform (64bit)
> Thank you​
> Mohammed Khalid
> Department of Chemistry
> University of Taif
> Saudi Arabia
> 
> 
> '
> ------------------------------------------------------------------------
> 
> هذه الرسالة ومرفقاتها (ان وجدت) تمثل وثيقة سرية قد تحتوي على معلومات 
> تتمتع بحماية وحصانة قانونية, ان لم تكن الشخص المعني بهذه الرسالة يجب 
> عليك تنبيه المرسل بخطأ وصولها إليك وحذف الرسالة ومرفقاتها (إن وجدت) من 
> الحاسب الالي الخاص بك ولايجوز لك نسخ هذه الرسالة او مرفقاتها (إن وجدت) 
> أو اي جزء منها أو البوح بمحتوياتها لأي شخص أو استعمالها لأي غرض علما بأن 
> الإفادات والاراء التي تحتويها هذه الرسالة تعبر فقط عن رأي المرسل وليس 
> بالضرورة رأي جامعة الطائف ولا تتحمل جامعة الطائف أي مسئولية عن الأضرار 
> الناتجة عن أي فايروسات قد يحملها هذا البريد .
> The information in this email and in any files transmitted with it is 
> intended only for the addressee and may contain confidential and/or 
> privileged material. Access to this email by anyone else is 
> unauthorized. If you receive this in error, please contact the sender 
> immediately and delete the material from any computer. If you are not 
> the intended recipient, any disclosure, copying, distribution or any 
> action taken or omitted to be taken in reliance on it, is strictly 
> prohibited. Statement and opinions expressed in this e-mail are those of 
> the sender, and do not necessarily reflect those of the Taif University.
> '. If the disclaimer can't be applied, attach the message to a new 
> disclaimer message. '
> ------------------------------------------------------------------------
> 
> هذه الرسالة ومرفقاتها (ان وجدت) تمثل وثيقة سرية قد تحتوي على معلومات 
> تتمتع بحماية وحصانة قانونية, ان لم تكن الشخص المعني بهذه الرسالة يجب 
> عليك تنبيه المرسل بخطأ وصولها إليك وحذف الرسالة ومرفقاتها (إن وجدت) من 
> الحاسب الالي الخاص بك ولايجوز لك نسخ هذه الرسالة او مرفقاتها (إن وجدت) 
> أو اي جزء منها أو البوح بمحتوياتها لأي شخص أو استعمالها لأي غرض علما بأن 
> الإفادات والاراء التي تحتويها هذه الرسالة تعبر فقط عن رأي المرسل وليس 
> بالضرورة رأي جامعة الطائف ولا تتحمل جامعة الطائف أي مسئولية عن الأضرار 
> الناتجة عن أي فايروسات قد يحملها هذا البريد .
> The information in this email and in any files transmitted with it is 
> intended only for the addressee and may contain confidential and/or 
> privileged material. Access to this email by anyone else is 
> unauthorized. If you receive this in error, please contact the sender 
> immediately and delete the material from any computer. If you are not 
> the intended recipient, any disclosure, copying, distribution or any 
> action taken or omitted to be taken in reliance on it, is strictly 
> prohibited. Statement and opinions expressed in this e-mail are those of 
> the sender, and do not necessarily reflect those of the Taif University.
> '. If the disclaimer can't be applied, attach the message to a new 
> disclaimer message.
> 
> 
> _______________________________________________
> Chimera-users mailing list: Chimera-users at cgl.ucsf.edu
> Manage subscription: http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users
> 



More information about the Chimera-users mailing list